Structura porului citoplasmatic al proteinei g, mediatoare a transportului ionilor de k+ -girk+

STRUCTURA PORULUI CITOPLASMATIC AL PROTEINEI G, MEDIATOARE A TRANSPORTULUI  IONILOR DE K⁺ -GIRK⁺

Structura de cristal, arata o singura subunitate, cu segmente N și C-terminale, ce formeaza o structura globuloasa, o proteina β-sheet, in principiu, cu subunitațile βA și βN, intre care se interpune un α-helix. Aceasta structura este prezenta in imunoglobuline și in arrestin - o proteina reglatoare a receptorului beta- adrenergic.

Capatul N-terminal interacționeaza cu cel C-terminal printr-o paralela β-sheet formata de subunitați βA și βM.

Interfața tetramerului conține atat aminoacizi polari cat și hidrofobi.

Capatul N-terminal formeaza o cavitate intre domeniile adiacente ale capatului C-terminal.

Tetramerul formeaza un por de 30Ǻ lungime cu un diametru de 7-15Ǻ, porul fiind ușor deschis aaat cat sa permita difuzia ionilor de K⁺ hidratați, din canalul transmembranar in soluția intracelulara.

Canalele IRK conțin și ele aceasta structura cu denumirea de por citoplasmatic al canalelor IRK, distinct prin tetramerul alcatuit din domeniul TM1 și subunitați Kvβ, asociate suprafeței intracelulare a canalelor de K⁺ voltaj- dependente. Tetramerul acestor canale nu dețin un por central pentru trecerea ionilor, rolul lor fiind in aparența, de a media interacțiunile de tip proteina-proteina și ligand-proteina, in expresia, reglajul și deschiderea programata a canalelor.

Fig.29.Cavitatea interna a canalelor IRK /

Porul citoplasmatic IRK este alcatuit din 4 subunitați, fața de β-sheet-ul continuu al porinelor. Acesta intefera cu porul transmembranar, alcatuit de helice aflate in apropierea suprafeței intracelulare.

Prin acești pori citoplasmatici trec mulți aminoacizi polari, cu exces de glutamat și aspartam, incarcate negativ, contribuind la inițierea unui potențial electrostatic negativ.

Aceasta distribuire a incarcaturii va avea ca efect concentrarea ionilor de K⁺ in aceasta regiune a porului, favorizand o conductanța crescuta și creand, deasemeni, oportunitatea cationilor impermeabili sa intre și sa blocheze porul dinspre interiorul celulei.